遵义医科大学基础医学院组织胚胎学教研室前身为大连医学院组织胚胎学教研室，于1947年成立，是大连医学院组建的首批教研室之一； 1969年教研室随大连医学院举校南迁至历史文化名城贵州省遵义市，建设成为遵义医学院组织胚胎学教研室，于2019年随着学校更名而改为遵义医科大学基础医学院组织胚胎学教研室。

首任教研室主任为胚胎学及细胞生物学家、中国医学科学院院士薛社普教授，后继历任教研室主任为袁保和教授、缪进敏教授、顾栋良副教授、才秀莲教授、陈伟教授。

目前教研室在编人员16人，其中教授1名，副教授3名，讲师8名，助教2名，助理实验师2名；具有博士6名，硕士8名（包括在读博士2名）；是一支年龄、职称、学历和学缘结构合理、教学和科研能力较强的团队。

在教学上，摸索出“PDCA”模式的教学管理制度，得到学校的鼓励、支持、表扬并向全校推广，规范的教学档案、考试档案多次在校内进行展览，多个院系到教研室来参观学习；在2018年进行的临床医学专业认证期间，教育部专家高度肯定了教研室规范的档案管理制度。在2007年先后开展多元化实验报告、《组织学》综合性实验、《组织学》实验考试改革、《组织学》理论知识与实验技能大赛（该项竞赛目前已经举办六届，是我校在基础教育阶段开展得最早的、连续性较长的校级本科生技能竞赛）等改革，并在当年获得了校级教学成果二等奖。从2008年开始，首先在遵义医学院开展互助小组学习教学模式，由于教学效果良好，该项教改在2012年获得校级成果一等奖、2013年获得贵州省教学成果奖三等奖，此后自今，在互助小组学习模式的基础上，陆续开展了云板书+互助+翻转课堂、实验课前置+翻转课堂等一系列教学改革，并荣获遵义医学院校级精品课程、遵义医学院校级优质课程、遵义医科大学首届教学成果奖三等奖，目前正在申请省级一流课程（金课）。

科研上，与解剖学教研室经过多年的共同努力，于2001年获人体解剖与组织胚胎学专业硕士学位授予点。自2002年起，开创了教研室的生殖毒理研究，形成了锰、砷生殖毒理的研究方向，经过十余年的持续研究，研究成果不断有所斩获：获贵州省科技进步奖三等奖、遵义市科学技术进步奖二等奖、三等奖等荣誉，为了促进教研室科研水平更上层楼，突出本学科的特色及优势，创建胚胎学基础研究平台，引进胚胎研究相关专业博士，经过努力，“生殖与胚胎发育生物学”于2016年成为遵义医学院扶持学科，填补我校在胚胎发生发育机制与生殖发育研究方向的空白；于2015年教研室时隔22年再次获得国家自然科学基金，教研室科研走上良性循环，在2018年再次突破，申请国家自然科学基金6项，获得资助4项，其中3项为地区基金、1项为青年基金，在2024年继续获得资助1项。

为了加强与兄弟院校的沟通与交流，在学校和基础医学院的大力支持下，教研室与形态学实验室于2012年7月21日-7月25日共同承办了全国基础医学实验教学研讨会暨全国基础医学形态学实验室主任联席会第五次会议；于2016年1月15日-18日与解剖学教研室共同承办了中国解剖学会教育与继续教育工作委员会2016年教学改革研讨会，两次会议均取得了圆满成功。有了2次办会的经验，于2023年7月16-19日成功承办了中国解剖学会组胚分会2023年学术年会暨第18届全国组织学与胚胎学青年学术研讨会（青组会），会议得到了参会各兄弟院校的高度好评。